Во внешнем отчете на СКД есть параметр типа справочник, но этот справочник определен в расширении.

Вопрос как добавить параметр на форму?

Не надо определять справочники в расширениях

(0) Исключительно программным способом. Либо в настройках параметров в схеме.
И да, (1) абсолютно верно, объекты метаданных должны быть в основной конфигурации.

(2) 💖