Есть регистр сведений обычный у которого два измерения: одно типа строка, другое типа дата и ресурс число. И вот это условие в запросе не отрабатывает, а когда пишешь:
"Где Дата  = НачалоПериода(Дата,День) = &День условие срабатывает. Кто знает от чего такая хрень?

уберите пробел после амперсанда и задайте секунды для ДатаОкончания 23:59:59

Запрос.УстановитьПараметр("ДатаОкончания", КонецДня(ДатаОкончания))

(2) Сработало Спс