На основании акта выполненных работ вводится корректировка реализации с видом корректировки исправление ошибок. Номенклатура в реализации имеет тип работа (чтобы собрать себестоимость можно было).
Появляются проводки в Дт41.К с содержанием перенос сальдо 41.К
Как теперь закрывать этот 41.К?

сам должен быть закрыться, смотри проводки дока реализации, там тоже должна быть проводка с 41К.

(1) В доке Акт выполненных работ нет вообще 41 счета (Дт90 Кт20). Продаем работу.

(2) у меня такой проводки корректировка не дает по работе, проверь ГФУ расчетов и по номенклатуре. 2.4.14.121

(1) кого то ждет увлекательные аттракционы

(3) ГФУ заполнено, но счет учета пустой. По умолчанию 10.09. Поэтому тут что-то другое включает эту проводку.