Альфа-авто.
Есть обработка которая заполняет ЗаказНаряд данными из ПеремещенияТоваров:
Функция Заполнить(ДокументОбъект, ТабЧасть, ЭтаФорма) Экспорт
    ВыбранныйДокумент = ОткрытьФормуМодально("Документ.ПеремещениеТоваров.ФормаВыбора");
    Если ВыбранныйДокумент <> Неопределено тогда
        для каждого строка из ВыбранныйДокумент.Товары цикл
            знстрока = ДокументОбъект.Товары.Добавить();
            ЗаполнитьЗначенияСвойств(знстрока, строка);
            знстрока.СкладКомпании = ВыбранныйДокумент.СкладПолучатель;
        конеццикла;
    конецесли;
Конецфункции
Как сделать так, чтобы при заполнении 2 и более раз ЗаказНаряда документом ПеремещениеТоваров, в Дереве Связей Документов выводились ВСЕ документы ПеремещениеТоваров, которыми был заполнен ЗаказНаряд?

Что за дерево связей?

(0) " ВыбранныйДокумент = ОткрытьФормуМодально("Документ.ПеремещениеТоваров.ФормаВыбора");
    Если ВыбранныйДокумент <> Неопределено тогда "
А это зачем?

(2) Форму могут закрыть крестиком

(0) Добавь в каждую добавляемую строку ссылку на ВыбранныйДокумент

(1) https://sun9-69.userapi.com/c205824/v205824002/13f0a/ojTCn5ehKqs.jpg

(0) Нужно переделать логику хранения основания в документе ЗаказНаряд что бы хранились все документы основания. Нужно переделать формирование формирование "дерева связей" что бы учитывались все документы основания ЗаказНаряда.

(5) Нужно смотреть, как оно строится, в зависимости от этого принимать решение.