Взносы в книгу доходов и расходов раздел 2  графа 7 попадают часть по начислению, а часть по оплате.  Мы хотим что бы все попадали по оплате, а например взносы в ФСС от несчастных случаев попадают 30 ноября т.е. когда начислялись. Где и как все это настроить?

(0) не получится. там куча факторов из-за которых последовательность сбивается. Например, заплатили на 100 рублей больше, или просто неправильно закрыли на другой месяц, эти 100 рублей так и будут у вас гулять многие и многие годы в виде отдельной суммы. Пока ручной операцией не закроете. Но потом какой-нибудь еще случай произойдет и опять всё собъется.

(1) Я в шоке

(2) но по идее, если висит какой-то остаток на счете, то всё правильно у вас: "часть по начислению, а часть по оплате"

(3) Нельзя ли сделать в настройках  что бы все было по оплате?

(4) нельзя, это противозаконно. А настройки в 1с - это только по законодательству.

поэтому лезьте в программу тогда, доработка программы.

(5) Я понял ... тогда как бы понять в каких случаях формирует по начислению а в каких по выплате?

(6) смотрите регистры ПрочиеРасчеты и РасходыУСН. Если по регистру закрылось, он пишет в книгу, если не закрылось, не пишет.

(7) Я попробовал все действительно так. Большое спасибо за помощь.