Нужно изменить формат в конкретной ячейке табличной части документа, именно программно, без условного форматирования в конфигураторе.
Но что то не могу добраться до свойства цвет фона, цвет шрифта :(
Что то типа:
ЦветПоляТаблицы = Новый Цвет (255,0,0);
Элементы.ДеревоЦен.ПроцентНаценки.ЦветФона = ЦветПоляТаблицы;    
Элементы.ДеревоЦен.ТекущаяСтрока.ПроцентНаценки.ЦветТекста = ЦветПоляТаблицы;
Выше написано не правильно, просто не знаю как объяснить без примера :)