в данном случаи интересует по конфигурации БП 2.0

и еще если я удаляю с базы все обмены как РИБ так  и обмен с УТ10.3 в них информация не зачистилась, нужно ли обработку по их очистке

Я перед и после каждой выгрузки это чищу, иначе такой трэш загружается - документы в справочники превращаются...

чтобы не искать ранее загруженные объекты, они берутся из этих регистров при обмене, тем самым ускоряя загрузку объектов

(3) То-то и оно, что когда поля поиска поменяли свои значения, то подбираться по этому регистру будет не то что нужно. до конца дней своих.