Форма выбора из справочника возвращает массив с записями типа СправочникСсылка и значением равным Наимаенованию выбранных объектов. Как получить по ним данные этого объекта? ПоискПоНаименованию возвращает первый попавшийся, а наименование у меня не уникально.
Вы видите представление в виде наименования. А значение элемента массива - ссылка на элемент справочник (тип значения).
Данные получаются прямо из ссылки (либо как-то, используя эту ссылку).