Есть документ Поступление товаров и услуг. У него указан Счет-фактура выданный.
Но он судя по всему является не реквизитом ПТиУ. т.е. ПТиУ является документом основанием у Счет фактуры.

Как правильно выгрузить счет фактуру при выгрузке ПТиУ?

Ведь если их отдельно выгружать не будет ли проблем? К примеру в случае если счет фактура не попадет в выбранный период?

Откуда, куда?

В общем сделал примерно так:
В ПВД "РеализацияТоваровУслуг" в обработчике "После выгрузки" такой код:

СчетФактура = УчетНДС.НайтиПодчиненныйДокумент(Объект.Ссылка, "СчетФактураВыданный");    
Если НЕ СчетФактура = Неопределено Тогда
    ВыгрузитьПоПравилу(СчетФактура, , , , "СчетФактураВыданный");
КонецЕсли;

А не лучше ли выписать счет фактура после загрузки? Движения получше лягут

(2) так и надо. если нет ссылки в поступлении

(3) если заказчик так захочет то я не против конечно. Но перелопачивать все поступления и реализации это же куча лишней работы.

(2) Похоже на УПП/КА, т.е. нужно выгружать только СФ созданных на основании?